肾盂肾炎的西医治疗原则是消灭细菌、预防复发、保持肾功能。在对症治疗、全身支持疗法的同时，应积极而合理地使用抗生素，以达到消灭细菌的目的，同时应防止肾毒性药物对肾脏的损害。肾盂肾炎选择抗生素的原则是：①选择有效的药物，应根据尿细菌增长及药敏试验选择抗生素；②针对部位选择药物，因其多为上尿路感染，应选择血药浓度高的药物，如红霉素等。急性肾盂肾炎常由上行感染而致，伴有下尿路感染者，可配合尿液中浓度高的抗生素，如呋喃柔啶等，氨苄青霉素在血中及尿中均可以达到较高的浓度，较为适宜。③选择有效而肾毒性小的药物，环丙氟哌酸、青霉素、红霉素等对肾毒均很小，但青霉素类在肾功能不良时应适当减少使用，疑有过敏者绝对禁用。氨苄青霉素、磺胺药亦应根据肾功能状况调整剂量。氨基糖甙类如庆大霉素、链霉素、卡那霉素等肾毒性较大，应当慎用。④减少耐药性，正确联合用药，如大肠杆菌可用氨苄青霉素合庆大霉素，变形杆菌可采用红霉素合呋喃柔啶治疗，对绿脓杆菌及金黄色葡萄球菌感染者，应当选择适当药物、掌握剂量，联合用药，以助于减少治疗该类感染有效药物的副作用。⑤适当调整尿液PH值，加强抗生素效力，一般而言酸性尿可抑制细菌繁殖，可用维生素C、氯化铵等以酸化尿液。但有的抗生素如磺胺类、红霉素在碱性尿液中作用加强，可选用NaHCO3、碱性合剂等以碱化尿液。
　　中药在治疗慢性与急性肾盂肾炎中均起到了较好的疗效，尤其对慢性肾盂肾炎，中医中药的疗效亦较肯定。中医学认为，素体不足、或年老体弱者，正气不足，尤其肾虚者，每易致外邪入侵，导致膀胱及下焦气化不利，变生诸症。根据其临床表现；可按中医中“淋证”治疗。淋证常分为气淋、血淋、石淋、热淋、劳淋、膏淋等。慢性肾盂肾炎多属劳淋范畴。急性肾孟肾炎以热淋为多见。具体可分为以下几型进行治疗。①膀胱湿热型：表现为尿频、尿急、尿痛，腰痛不适，尿时有灼热感，尿色多赤且较混浊、伴有恶寒、发热，或寒热往来，舌质红苔薄腻或黄腻，脉多滑数。治宜清热化湿、利尿通淋，可用八正散治疗，药用如扁蓄、留麦、木通、山桅、滑石、大黄、车前草等。若热偏重可用导赤散，药如竹叶、木通、生甘草、生地等；湿偏重可加佩兰、猪苓等化浊药；寒热往来者可合用小柴胡汤，药用柴胡、黄芩、半夏、党参等。清热解毒药如蒲公英、土茯苓、败酱草等可酌情加用，③湿热伤络型：反复血尿，尿色多赤，舌红苔黄，脉数为主症，宜清热比湿，凉血止血，方用小蓟饮子，药用如小蓟、蒲黄、藕节、白茅根、滑石、山桅、赤芍、紫草、生地榆等。③阴虚湿热型：病程日久，或素体阴虚，反复不愈，尿时不爽，或有血尿，低热不退，舌红少苔或夹黄腻苔，脉细数或濡数。宜养阴清热佐以化湿，方用猪苓汤为主化裁，药如猪苓、茯苓、滑石、阿胶，生地、丹皮、赤芍、旱莲草、藕节等。④阴虚火旺，下焦亏虚型：反复发作的肾盂肾炎，阴虚不足，腰酸腿软，低热盗汗，五心烦热，伴有高血压，偶有血尿，舌红少苔而瘦，脉细数。宜养阴清热为主，方用知柏地黄九，药用如知母、黄柏、生地、山茱萸、泽泻、茯苓、丹皮，大小蓟、旱莲草。血压偏高者可加用生龙牡、石决明、夏枯草等。⑤脾肾气虚 型：多为病已日久，脾肾不足，多兼有余邪不尽，尿时不畅，尿色清长，腰膝无力，不耐疲劳、形体怕冷，大便偏软，面色苍白，舌淡胖苔薄，脉沉而迟。宜益肾健脾。佐以祛邪，方选用泰山磐石散，亦可用八味地黄丸合方君子汤化裁，药用桑寄生、杜仲、川断、淮山药、山茱萸、茯苓、白术、党参、黄芪等。余邪未尽者，应慎用肉桂、附子等大辛大热之药，可稍佐蒲公英、小蓟、车前草等祛邪解毒之品，以达攻补兼施之效。中药治疗肾盂肾炎有几个优点，一是方法较多，适应面广，可以照顾不同体质与个体的需要；二是副作用少，目前尚无肾毒性的报道；三是疗效可靠，远期疗效亦较好；四是配合西药，可达相辅相成的作用，有利于提高疗效，减少抗生素用量，缩短疗程。尤其对慢性肾盂肾炎，中医中药具有良好的应用前景。
　　有些病人认为没有症状，肾盂肾炎就好了。实际上，有许多肾盂肾炎本身症状就不重，甚则没有，因此症状消失不是肾盂肾炎的治愈标准。肾盂肾炎治好了的标准是：尿常规正常，尿中细菌培养阴性，且需每月做1～2次，持续6个月均为阴性，同时肾功能检查亦正常。

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