慢性肾炎的诊断除了掌握各型肾炎的临床表现外，还应进行全面的实验室检查，主要有尿常规检查，包括尿蛋白定性、定量，蛋白选择性，尿沉渣检查。有条件者还应测定尿酶、尿FDP等；肾功能实验，应常规检查BUN、Scr，有异常时可做酚红排泄试验、肌酐清除率、浓缩试验等；血浆白蛋白测定与脂质分析，有条件者可做血清补体和免疫球蛋白测定。
　　慢性肾炎的诊断方法有：临床诊断，明确临床分型；病理形态学诊断，明确病理分型；免疫荧光方法诊断。后两者多配合应用，必须依靠肾穿刺活体组织检查。总之，慢性肾炎的诊断，最好临床与病理诊断相结合。 慢性肾炎的诊断还应与以下几种疾病相鉴别。
　　①大量蛋白尿者应与肾病综合征相鉴别。两者均可表现为水肿。低蛋白血症，但原发性肾病综合征Ⅰ型多无血尿及高血压。肾病综合征Ⅰ型的蛋白尿多为有选择性蛋白尿，而慢性肾炎大量蛋白尿多为无选择性蛋白尿等。
　　②若女性病人表现出慢性肾炎普通型，还应与慢性肾盂肾炎相鉴别。慢性肾盂肾炎多有泌尿系感染的病史，尿细菌培养可见阳性。尿沉渣爱迪氏计数多见异常，尤其活动性的慢性肾盂肾炎。慢性肾盂肾炎肾功能损害以肾小管为主，且进展缓慢，严重者可出现氮质血症或尿毒症。肾图、B超、静脉肾孟造影可发现肾盂受损的改变。
　　③若慢性肾炎高血压型还应与高血压引起的肾脏损害相鉴别。首先病史方面，前者多先有肾脏病史，后有高血压，且血压多不高，而高血压引起的肾脏病，多先有病程较长的高血压病史，而后才出现肾脏表现。此外，高血压引起的肾脏损害，尿蛋白多不重，很少有血尿，但肾功能损害较重。
　　④与其它继发性肾炎相鉴别：凡以血尿或肾病综合征表现突出者应与狼疮性肾炎相鉴别，尤其女性患者；高龄患者（中老年）应与糖尿肾病相区别。此外，还应与淀粉样变肾损害、多发性骨髓瘤肾损害、痛风性肾损害、乙肝相关性肾炎等相鉴别。
　　⑤慢性肾炎急性发作还应注意与急性肾炎相鉴别。 以上各种鉴别诊断，通过肾穿刺活体组织检查，从病理学上亦可找到一些相互鉴别的重要依据。

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